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用于分子诊断测试分配和测试之间兼容性确定的外部文件的制作方法
【专利摘要】本文所公开的实施例涉及执行自动化验的方法和系统，并且具体地涉及对自动化仪器上的多个样本执行化验。
【专利说明】用于分子诊断测试分配和测试之间兼容性确定的外部文件
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2012 年 2 月 3 日提交的题为 “EXTERNAL FILES FOR DISTRIBUT1NOF MOLECULAR DIAGNOSTIC TESTS AND DETERMINAT1N OF COMPATIBILITY BETWEENTESTS(用于分子诊断测试分配和测试之间兼容性确定的外部文件)”的美国临时申请序列号61/594867的优先权，其全部内容通过引用并入本文。

【技术领域】
[0003]本文所公开的实施例涉及用于执行自动化验的方法和系统，并且具体地涉及对自动化仪器上的多个样本执行多个化验。

【背景技术】
[0004]医疗诊断行业是当今医疗保健基础设施的关键要素。在过去的十年中，用于诊断测试的核酸碱基化验的使用已经变得越来越普遍。诊断测试中处理和测试样本的自动化是有吸引力的，因为它将实验变异性最小化并且降低了对高度训练的技术人员的需要。除了在诊断领域中的益处，处理和测试样本的自动化促进了高产出测试。
[0005]可以理解，出于诸如诊断测试或高产出测试的目的，处理样本可以分解成若干关键步骤，通常期望自动化一个或更多个步骤。例如，在诊断的情况下，生物样本，诸如从患者获得的那些样本，能够用在核酸扩增化验，以便扩增关注的目标核酸(例如，DNA、RNA等)。一旦扩增，目标核酸的存在，或者目标核酸的扩增产物(例如，目标扩增子)能够被检测到，其中目标核酸和/或目标扩增子的存在用于识别和/或量化目标(例如，目标微生物等)的存在。通常，核酸扩增化验涉及多个步骤，其能够包括核酸提取、核酸扩增和检测。理想的是使这些过程的某些步骤自动化。
[0006]需要改进的方法和设备用于对多个样本并行执行化验。本文所描述的实施例解决这一需要并且能够有利地用于临床和研究环境。


【发明内容】

[0007]本技术涉及用于执行自动化验的方法和系统，并且具体地涉及在自动化仪器上的多个样本上执行多个化验。在本技术的一些实施例中，当化验工作流程兼容时，这种方法和系统能够允许仪器上的分立化验工作流程的并发执行，并且能够防止在相同工作站内不兼容的化验的并发执行。一些实施例涉及在自动化仪器上执行多个用户定义协议(UDP)。一些实施例涉及执行化验制造商开发的多个化验定义文件(ADF)。一些实施例涉及在相同自动化仪器上并发执行一个或更多UDP (可选地结合一个或更多个ADF)。
[0008]在本文提出的技术的一些实施例中，提供对多个样本执行自动化验的方法，这些方法允许在自动化仪器上执行化验时改进的可靠性和易用性。所述方法能够包括提供包括第一工作站和第二工作站的自动化仪器，所述第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有关联的独特化验定义或用户定义协议文件；针对自动化仪器上的并发处理确定两个分立的化验工作流程是否彼此兼容或不兼容；以及当所述化验兼容时在所述仪器上并发执行所述分立的化验工作流程。
[0009]在一些实施例中，化验定义或用户定义协议文件能够包括第一级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤包括:(a)从可用化验的第一列表中选择第一化验；以及(b)将具有包括相同的第一级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为第一化验，其中相同的第一级别兼容性指标值表示第一级别兼容性。
[0010]在一些实施例中，所述评估步骤能够包括(bl)识别具有不同于第一化验的第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验；以及(b2)提供第二化验的第二列表，其中所述第二列表不包括具有不同于第一化验的第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验。
[0011]在一些实施例中，每个化验定义文件能够包括第二级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤能够进一步包括(C)将具有包括相同的第二级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为第一化验，其中相同的第二级别兼容性指标值表示第二级别兼容性。
[0012]在一些实施例中，所述评估步骤能够包括(Cl)识别具有不同于第一化验的第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验；以及(c2)提供第二化验的第二列表，其中所述第二列表不包括具有不同于第一化验的第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验。
[0013]在一些实施例中，第一级别兼容性能够包括在单个工作站处并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:培育时间、裂解时间、试剂体积、试剂类型、培育温度、裂解温度、工作站时间需求、监管分类、商业考虑及其组合。
[0014]在一些实施例中，第二级别兼容性能够包括所述自动化仪器上并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:监管分类、工作流程非兼容性、商业考虑及其组合。
[0015]在一些实施例中，当第一兼容性指标不同时，所述仪器阻止相同工作站内的不兼容化验的并发执行。在一些实施例中，两个分立的化验工作流程在相同的工作站中执行。在一些实施例中，仪器防止并发执行具有不同的第二兼容性指标值的化验。在一些实施例中，两种化验具有相同的第一级别兼容性指标值并且具有不同的第二级别兼容性指标值。在一些实施例中，第二级别兼容性指标值中的不同能够包括商业原因。在一些实施例中，第二级别兼容性指标值中的不同能够包括监管分类。
[0016]在一些实施例中，如果化验是兼容的，所述方法能够进一步包括以下步骤中的一项或更多项:(d)在所述仪器上启动化验特定样本制备脚本；(e)将消费品包装上的识别标记与存储在仪器上的一组化验特定识别数据进行比较；(f)在仪器上启动化验特定加载盒脚本；(g)将加载的盒中的可检测信号荧光比率的级别与存储在所述仪器上的一组化验特定可检测信号数据进行比较，以确定所述盒是否成功加载；(h)在所述仪器上启动化验特定反应脚本；(i)在所述仪器上启动化验特定数据分析算法；或(j)基于一个或更多个化验特定结果算法或脚本得到化验的最终结果。
[0017]在一些实施例中，化验协议能够包括从选自下列项的组中选择的反应:聚合酶链式反应(PCR)、转录介导的扩增(TMA)、寡核苷酸连接分析(OLA)、连接酶链反应(LCR)、滚环扩增(RCA)、链置换扩增(SDA)和杂交反应。
[0018]本文还提出一种用于执行自动化验的系统，该系统包括自动化仪器，其包括第一工作站和第二工作站，第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有关联的独特化验定义文件或用户定义协议文件；处理器；存储装置；以及用于执行自动化验的程序，所述程序包括用于确定两个分立的化验工作流程是否彼此兼容或不兼容以用于自动化仪器上进行并发处理的指令；以及当化验兼容时在所述仪器上并发执行所述分立的化验工作流程的指令。
[0019]在上述系统的一些实施例中，化验定义文件或用户定义协议文件能够包括第一级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤能够包括:(a)从可用化验的第一列表中选择第一化验；以及(b)将具有包括相同的第一级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为第一化验，其中相同的第一级别兼容性指标值表示第一级别兼容性。
[0020]在上述系统的一些实施例中，所述评估步骤能够包括(bl)识别具有不同于第一化验的第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验；以及(b2)提供第二化验的第二列表，其中第二列表不包括具有不同于第一化验的第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验。
[0021]在上述系统的一些实施例中，每个化验定义文件能够包括第二级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤能够进一步包括(C)将具有包括相同的第二级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为第一化验，其中相同的第二级别兼容性指标值表示第二级别兼容性。
[0022]在上述系统的一些实施例中，所述评估步骤能够包括(Cl)识别具有不同于第一化验的第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验；以及(c2)提供第二化验的第二列表，其中第二列表不包括具有不同于第一化验的第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验。
[0023]在上述系统的一些实施例中，第一级别兼容性能够包括在单个工作站处并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:培育时间、裂解时间、试剂体积、试剂类型、培育温度、裂解温度、工作站时间需求、监管分类、商业考虑及其组合。
[0024]在上述系统的一些实施例中，第二级别兼容性能够包括在自动化仪器上并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:监管分类、工作流程非兼容性、商业考虑及其组合。
[0025]在上述系统的一些实施例中，当第一兼容性指标不同时，所述仪器阻止在相同工作站内进行不兼容的化验的并发执行。在一些实施例中，两个分立的化验工作流程在相同的工作站中执行。在一些实施例中，所述仪器阻止并发执行具有不同的第二兼容性指标值的化验。在一些实施例中，两种化验具有相同的第一级别兼容性指标值并且具有不同的第二级别兼容性指标值。在一些实施例中，第二级别兼容性指标值中的不同能够包括商业原因。在一些实施例中，第二级别兼容性指标值中的不同能够包括监管分类。
[0026]在上述系统的一些实施例中，如果化验是兼容的，所述系统能够进一步包括用于下列步骤的一项或更多项的指令:(d)在仪器上启动化验特定样本制备脚本；(e)将消费品包装上的识别标记与存储在仪器上的一组化验特定识别数据进行比较；(f)在仪器上启动化验特定加载盒脚本；(g)将加载的盒中的可检测信号的级别与存储在所述仪器上的一组化验特定可检测信号数据进行比较，以确定所述盒是否成功加载；(h)在仪器上启动化验特定反应脚本；(i)在仪器上启动化验特定数据分析算法；或(j)基于一个或更多个化验特定结果算法或脚本得到化验的最终结果。
[0027]在上述系统的一些实施例中，所述化验协议能够包括从选自下列项中的组中选择的反应:聚合酶链式反应(PCR)、转录介导的扩增(TMA)、寡核苷酸连接分析(OLA)、连接酶链反应(LCR)、滚环扩增(RCA)、链置换扩增(SDA)和杂交反应。
[0028]在上述系统的一些实施例中，所述系统能够进一步包括条形码阅读器。在上述系统的一些实施例中，所述识别标记能够包括条形码。
[0029]本文还提出一种在单个自动化仪器上并发执行多个兼容性分立化验的方法，针对每个分立的化验，该方法包括:提供包括第一工作站和第二工作站的自动化仪器，所述第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有包括第一级别兼容性指标值和第二级别兼容性指标值的关联的独特化验定义文件或用户定义协议文件；从可用化验的第一列表中选择第一化验；将具有包括相同的第一级别兼容性指标值的化验定义文件或用户定义协议文件的多个其他可用化验评估为第一化验，其中相同的第一级别兼容性指标值表示用于在自动化仪器的相同工作站上并发处理的兼容性；将具有包括相同的第二级别兼容性指标值的化验定义文件或用户定义协议文件的多个其他可用化验评估为第一化验，其中相同的第二级别兼容性指标值表示用于在所述自动化仪器上并发处理的兼容性；以及当所述化验兼容时在所述仪器上并发执行分立的化验工作流程。

【专利附图】

【附图说明】
[0030]图1示出将第一级别兼容性指标值和第二级别兼容性指标值分配到具体化验工作流程或用户定义协议(UDP)的方法的示意图。
[0031]图2示出根据一个实施例识别两个化验协议之间的第一级别兼容性和第二级别兼容性的方法的示意图。
[0032]图3示出根据一个实施例选择和执行并发化验协议的方法的示意图。
[0033]图4示出根据一个实施例的具有独立工作站和共享服务的自动化仪器的示意图。
[0034]图5示出根据一个实施例的机架(rack)和运行兼容性的查找表。

【具体实施方式】
[0035]自动诊断仪器现在能够并行执行多个样本的处理和测在。这些设备能够有利地用于高产出应用以帮助样本制备和测试。通过举例的方式，自动诊断仪器能够制备用于核酸扩增化验的样本，并执行扩增和检测。然而，根据样本类型和化验类型，相同仪器上的化验协议常常彼此不兼容，或者因为仪器上的物理限制，或者出于商业原因。例如，任何两个化验协议可具有不同的培育时间、裂解时间、试剂体积、试剂类型、培育温度、裂解温度、工作站时间需求、或使得仪器在单个工作站中对样本执行不同化验成为不可能的其他参数。除了物理限制之外，监管分类和商业方面的考虑均是可以阻止仪器并发处理样本的因素。为了解决这一问题，用户必须在图表或表格上手动比较化验协议，以确定它们是否能够在相同机架上并发执行或甚至相同仪器的不同机架上并发执行。这种手动方法容易出错、效率低并且是劳动强度大。因此，对于识别兼容化验协议以及阻止不兼容的化验协议并发执行的改进方法有很大需要。
[0036]根据上述情况，本文提供用于在自动化仪器上执行化验协议的方法和系统。在本技术的一些实施例中，当化验工作流程兼容时，这种方法和系统能够允许在仪器上的分立化验工作流程的并发执行，并且能够阻止在相同仪器内不兼容化验的并发执行。本文提供的方法允许在自动化仪器上执行化验时的改进的可靠性和易用性。
[0037]因此，本文提供的一种方法，其提供包括第一工作站和第二工作站的自动化仪器以及两个工作站共享的共同服务，第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有关联的独特化验定义或用户定义协议文件；确定两个分立的化验工作流程是否彼此兼容或不兼容以用于自动化仪器上的并发处理；以及当化验兼容时在仪器上并发执行分立的化验工作流程。
[0038]如本文所用的术语“工作站”、“机架”等术语指的是能够将多个样本容纳在设计为一起处理那些样本的仪器内的组件。因此，能够在相同机架上并发执行的两个工作流程在本文中被称为“机架兼容”。
[0039]能够在相同仪器上并发执行的两个工作流程在本文中被称为“运行兼容”。在某些实施例中，两个运行兼容的工作流程在相同机架上不兼容，但是能够在仪器的分离机架上执行。在某些实施例中，两个运行兼容的工作流程在相同的机架上是兼容的。在某些其他实施例中，两个运行不兼容的工作流程在相同机架上兼容，但是因为各种原因的任何一个，不能在相同仪器上并发执行。
[0040]如本文所用，术语“工作流程”、“化验工作流程”、“化验”、“化验协议”、“测试”等术语指的是用于处理样本的过程。在典型实施例中，工作流程能够包括样本制备步骤，诸如细胞裂解、核酸提取、核酸纯化、核酸消化、核酸改性、蛋白质提取、蛋白质纯化等。在本文所公开的实施例中核酸提取的有用的若干种方法在本领域中是已知的。核酸提取的示例性讨论，能够在例如2008年7月11日提交的美国专利申请12/172，214、2008年7月11日提交的美国专利申请12/172，208、2005年11月16日提交的美国专利申请11/281,247中找到，所有这些文献的全部内容通过引用并入在此。类似地，蛋白质提取的示例性讨论能够在例如美国专利号8，053, 239和6，864，100中找到，其所有全部内容通过引用并入在此。
[0041]在一些典型实施例中，工作流程还能够包括核酸扩增反应。在一些典型实施例中，工作流程能够进一步包括数据分析过程。
[0042]因此，在某些实施例中，由于物理差异(诸如培育时间、裂解时间、试剂体积、试剂类型、培育温度、裂解温度、工作站时间等)，工作流程彼此不直接兼容。这些参数的每一个将独特物理限制置于工作站本身的运动和容量或自动化仪器内的共享服务资源上。例如，RNA提取协议、DNA提取协议和蛋白质提取协议的每个会要求仪器上的吸液管头的不同运动，因此无法在相同时间在相同工作站上进行处理。通过另一个实例，PCR化验以及仅仅基于到目标的可检测探针的杂交的化验会需要不同的温度周期变化和时序要求，并且因此无法同时处理。应当理解，任何物理、时间或其他限制能够呈现两个工作流程不与彼此直接兼容的理由。
[0043]在某些实施例中，不兼容性由两个或更多工作站共享的自动化仪器内的共享服务资源的运动和容量上的物理限制导致。如图4所示，两个或更多个独立的工作站能够利用共享资源。共享资源能够是，例如，吸液管、机械臂、单一检测器单元，或两个或更多工作站共享的任何其他资源。
[0044]为了表明兼容性，化验之间的物理、时间或其他参数不需要相同。相反，参数能够落入具有例如共享资源的兼容性的范围之内。以下在实例I的表2中提供具有在范围内变化但仍保持兼容性的参数的化验的实例，而具有任何一个范围之外的参数的化验不再兼容。
[0045]此外，仪器上在其他方面物理兼容的工作流程能够出于其他原因不兼容。在某些实施例中，为了遵循监管限制，两个工作流程不能并发执行。例如，如果一个化验协议已通过监管机构诸如美国食品和药物管理局(FDA)批准，该机构可规定，化验协议不能与未经批准的化验协议并发执行。类似地，在某些实施例中，仪器、耗材或试剂的制造商或用户会受到合约限制或其他商务限制，在其限制下两个工作流程不能在相同仪器上并发执行。应当理解，非兼容性能够出于制造商或用户确定两个工作流程应该不兼容的任何原因而确定。本文提供的方法和系统使得识别兼容的工作流程和同时在相同仪器上执行多个兼容工作流程成为可能。
[0046]如图3所示，机架和运行兼容性能够由任何若干工作流程参数确定。例如，可确定机架或运行兼容性的参数包括，但不限于，试剂条设计、可消耗试剂的数量和类型和工作流程期间执行的具体过程，诸如核酸提取或提取后的核酸样本全分析。
[0047]化验定义文件
[0048]在本文提供的所述方法和系统的实施例中，每个不同的自动化验的工作流程具有关联的独特化验定义或用户定义协议文件。如本文所用，术语化验定义文件(ADF)指的是提供至少一些并且通常是所有的用于那个工作流程的化验特定参数的文件。此外，ADF能够为具体工作流程提供兼容性指标值。在典型实施例中，ADF能够包含自动化仪器上运行化验所需要的所有信息。ADF的一个功能是提供仪器和化验之间的独立性层。仪器制造商或化验试剂制造商通过这种独立性提供的机制能够发布仪器的新的化验协议而不对仪器软件造成重大修改。
[0049]ADF能够包括以下表1中列出的一个或更多个组分。具体地，ADF能够包括机架和运行兼容性的两级别指标值。
[0050]表1.ADF参数和设置
[0051]

【权利要求】
1.一种对多个样本执行自动化验的方法，所述方法包括: 提供包括第一工作站和第二工作站的自动化仪器，所述第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有关联的独特化验定义或用户定义协议文件； 确定两个分立的化验工作流程是否彼此兼容或不兼容，以用于所述自动化仪器上的并发处理；以及 当所述化验兼容时，在所述仪器上并发执行所述分立的化验工作流程。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述化验定义或用户定义协议文件包括第一级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤包括: (a)从可用化验的第一列表中选择第一化验；以及 (b)将具有包括相同的第一级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为所述第一化验，其中所述相同的第一级别兼容性指标值表示第一级别兼容性。
3.根据权利要求2所述的方法，其中所述评估步骤包括: (bl)识别具有不同于所述第一化验的第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验；以及 (b2)提供第二化验的第二列表，其中所述第二列表不包括具有不同于所述第一化验的所述第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验。
4.根据权利要求2所述的方法，其中每个化验定义文件包括第二级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤进一步包括: (c)将具有包括相同的第二级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为所述第一化验，其中所述相同的第二级别兼容性指标值表示第二级别兼容性。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述评估步骤包括: (Cl)识别具有不同于所述第一化验的第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验；以及 (c2)提供第二化验的第二列表，其中所述第二列表不包括具有不同于所述第一化验的所述第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验。
6.根据权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述第一级别兼容性包括在单个工作站处并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:培育时间、裂解时间、试剂体积、试剂类型、培育温度、裂解温度、工作站时间需求、监管分类、商业考虑及其组合。
7.根据权利要求4-6中任一项所述的方法，其中所述第二级别兼容性包括在所述自动化仪器上并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:监管分类、工作流程非兼容性、商业考虑及其组合。
8.根据权利要求6所述的方法，其中当所述第一兼容性指标不同时所述仪器阻止在相同工作站内的不兼容的化验的并发执行。
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述两个分立的化验工作流程在相同的工作站中执行。
10.根据权利要求7所述的方法，其中所述仪器防止并发执行具有不同的第二兼容性指标值的化验。
11.根据权利要求4-10中任一项所述的方法，其中两种化验具有相同的第一级别兼容性指标值并具有不同的第二级别兼容性指标值。
12.根据权利要求11所述的方法，其中所述第二级别兼容性指标值中的所述不同包括商业原因。
13.根据权利要求11所述的方法，其中所述第二级别兼容性指标值中的所述不同包括监管分类。
14.根据权利要求1所述的方法，其中如果所述化验是兼容的，所述方法进一步包括下列步骤中的一项或更多项: (d)在所述仪器上启动化验特定样本制备脚本； (e)将消费品包装上的识别标记与存储在所述仪器上的一组化验特定识别数据进行比较； (f)在所述仪器上启动化验特定加载盒脚本； (g)将加载的盒中的荧光比与存储在所述仪器上的一组化验特定荧光比数据进行比较，以确定所述盒是否成功被加载； (h)在所述仪器上启动化验特定反应脚本； (i)在所述仪器上启动化验特定数据分析算法； U)基于一个或更多个化验特定结果算法或脚本，得到所述化验的最终结果。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述化验协议包括从选自下列项的组中选择的反应:聚合酶链式反应即PCR、转录介导扩增即TMA、寡核苷酸连接分析即OLA、连接酶链反应即LCR、滚环扩增即RCA、链置换扩增即SDA和杂交反应。
16.—种用于执行自动化验的系统,其包括: 自动化仪器，其包括第一工作站和第二工作站，所述第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有关联的独特化验定义文件或用户定义协议文件； 处理器； 存储装置；以及 用于执行自动化验的程序，所述程序包括: 确定两个分立的化验工作流程是否彼此兼容或不兼容以用于在所述自动化仪器上的并发处理的指令；以及 在所述化验兼容时在所述仪器上并发执行所述分立化验工作流程的指令。
17.根据权利要求16所述的系统，其中所述化验定义文件或用户定义协议文件包括第一级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤包括: (a)从可用化验的第一列表中选择第一化验；以及 (b)将具有包括相同的第一级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为所述第一化验，其中所述相同的第一级别兼容性指标值表示第一级别兼容性。
18.根据权利要求17所述的系统，其中所述评估步骤包括: (bl)识别具有不同于所述第一化验的第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验；以及 (b2)提供第二化验的第二列表，其中所述第二列表不包括具有不同于所述第一化验的所述第一兼容性指标值的第一级别兼容性指标值的任何化验。
19.根据权利要求17所述的系统，其中每个化验定义文件包括第二级别兼容性指标值，并且其中所述确定步骤进一步包括: (C)将具有包括相同的第二级别兼容性指标值的化验定义文件的多个其他可用化验评估为所述第一化验，其中所述相同的第二级别兼容性指标值表示第二级别兼容性。
20.根据权利要求19所述的系统，其中所述评估步骤包括: (Cl)识别具有不同于所述第一化验的第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验；以及 (c2)提供第二化验的第二列表，其中所述第二列表不包括具有不同于所述第一化验的所述第二兼容性指标值的第二级别兼容性指标值的任何化验。
21.根据权利要求17-20中任一项所述的系统，其中所述第一级别兼容性包括在单个工作站处并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:培育时间、裂解时间、试剂体积、试剂类型、培育温度、裂解温度、工作站时间需求、监管分类、商业考虑及其组口 ο
22.根据权利要求19-21中任一项所述的系统，其中所述第二级别兼容性包括在所述自动化仪器上并发执行两种化验的兼容性，所述参数选自包括下列项的组中:监管分类、工作流程非兼容性、商业考虑及其组合。
23.根据权利要求21所述的系统，其中当所述第一兼容性指标不同时，所述仪器阻止在相同工作站内的不兼容化验的并发执行。
24.根据权利要求23所述的系统，其中所述两个分立的化验工作流程在所述相同的工作站中执行。
25.根据权利要求22所述的系统，其中所述仪器阻止并发执行具有不同的第二兼容性指标值的化验。
26.根据权利要求19-25中任一项所述的系统，其中两种化验具有相同的第一级别兼容性指标值并且具有不同的第二级别兼容性指标值。
27.根据权利要求26所述的系统，其中所述第二级别兼容性指标值中的所述不同包括商业原因。
28.根据权利要求26所述的系统，其中所述第二级别兼容性指标值中的所述不同包括监管分类。
29.根据权利要求16所述的系统，其中如果所述化验是兼容的，所述方法进一步包括下列步骤中的一个或更多个: (d)在所述仪器上启动化验特定样本制备脚本； (e)将消费品包装上的识别标记与存储在所述仪器上的一组化验特定识别数据进行比较； (f)在所述仪器上启动化验特定加载盒脚本； (g)将加载的盒中的荧光比与存储在所述仪器上的一组化验特定荧光比数据进行比较，以确定所述盒是否成功加载； (h)在所述仪器上启动化验特定反应脚本； (i)在所述仪器上启动化验特定数据分析算法； U)基于一个或更多个化验特定结果算法或脚本，得到所述化验的最终结果。
30.根据权利要求29所述的系统，其中所述化验协议包括从选自下列项的组中选择的反应:聚合酶链式反应即PCR、转录介导的扩增即TMA、寡核苷酸连接分析即OLA、连接酶链反应即LCR、滚环扩增即RCA、链置换扩增即SDA和杂交反应。
31.根据权利要求16所述的系统，其中所述系统进一步包括条形码阅读器。
32.根据权利要求29所述的系统，其中所述识别标记包括条形码。
33.一种在单个自动化仪器上并发执行多个兼容性的分立化验的方法，针对每个分立的化验，所述方法包括: 提供包括第一工作站和第二工作站的自动化仪器，所述第一工作站和第二工作站的每个经配置以根据多个不同的自动化验工作流程接收和处理多个样本，其中每个不同的自动化验工作流程具有包括第一级别兼容性指标值和第二级别兼容性指标值的关联的独特化验定义文件或用户定义协议文件； 从可用化验的第一列表中选择第一化验； 将具有包括相同的第一级别兼容性指标值的化验定义文件或用户定义协议文件的多个其他可用化验评估为所述第一化验，其中所述相同的第一级别兼容性指标值表示用于在所述自动化仪器的相同工作站上并发处理的兼容性； 将具有包括相同的第二级别兼容性指标值的化验定义文件或用户定义协议文件的多个其他可用化验评估为所述第一化验，其中所述相同的第二级别兼容性指标值表示用于在所述自动化仪器上并发处理的兼容性；以及 当所述化验兼容时在所述仪器上并发执行所述分立化验工作流程。
【文档编号】G01N35/00GK104204812SQ201380018535
【公开日】2014年12月10日 申请日期:2013年2月1日 优先权日:2012年2月3日
【发明者】A·斯蒂尔, T·沃杰克, M·扬, M·拉森 申请人:贝克顿·迪金森公司